Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPAP23025 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPAP23025 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPAP23025 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPAP23025 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPAP23025 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XPAP23025 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XPAP23025 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPAP23025 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPAP23025 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPAP23025 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPAP23025 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPAP23025 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPAP23025 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPAP23025 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPAP23025 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPAP23025 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPAP23025 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPAP23025 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPAP23025 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
XPAP23025 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPAP23025 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPAP23025 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPAP23025 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPAP23025 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPAP23025 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPAP23025 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
XPAP23025 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPAP23025 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPAP23025 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPAP23025 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPAP23025 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPAP23025 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPAP23025 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPAP23025 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPAP23025 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPAP23025 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPAP23025 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPAP23025 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPAP23025 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPAP23025 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPAP23025 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPAP23025 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPAP23025 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPAP23025 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPAP23025 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPAP23025 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPAP23025 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPAP23025 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPAP23025 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPAP23025 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPAP23025 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPAP23025 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPAP23025 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPAP23025 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPAP23025 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XPAP23025 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XPAP23025 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XPAP23025 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XPAP23025 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPAP23025 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPAP23025 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPAP23025 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPAP23025 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPAP23025 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
XPAP23025 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPAP23025 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPAP23025 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPAP23025 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPAP23025 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPAP23025 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPAP23025 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPAP23025 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPAP23025 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPAP23025 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPAP23025 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPAP23025 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPAP23025 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPAP23025 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPAP23025 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPAP23025 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPAP23025 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPAP23025 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPAP23025 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPAP23025 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPAP23025 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPAP23025 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XPAP23025 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPAP23025 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPAP23025 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPAP23025 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPAP23025 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPAP23025 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPAP23025 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPAP23025 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPAP23025 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPAP23025 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPAP23025 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPAP23025 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPAP23025 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms