Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCAM1P19320 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCAM1P19320 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms