Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDCP19113 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDCP19113 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDCP19113 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDCP19113 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDCP19113 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDCP19113 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDCP19113 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDCP19113 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HDCP19113 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDCP19113 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDCP19113 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDCP19113 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDCP19113 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDCP19113 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDCP19113 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDCP19113 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDCP19113 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDCP19113 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDCP19113 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDCP19113 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDCP19113 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDCP19113 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDCP19113 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDCP19113 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDCP19113 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDCP19113 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDCP19113 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDCP19113 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDCP19113 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDCP19113 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDCP19113 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDCP19113 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDCP19113 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDCP19113 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDCP19113 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDCP19113 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HDCP19113 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDCP19113 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDCP19113 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDCP19113 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDCP19113 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDCP19113 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDCP19113 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDCP19113 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HDCP19113 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDCP19113 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDCP19113 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDCP19113 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDCP19113 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDCP19113 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDCP19113 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDCP19113 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDCP19113 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HDCP19113 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDCP19113 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDCP19113 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDCP19113 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HDCP19113 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDCP19113 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDCP19113 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HDCP19113 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDCP19113 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HDCP19113 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDCP19113 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDCP19113 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDCP19113 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDCP19113 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDCP19113 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDCP19113 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDCP19113 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDCP19113 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDCP19113 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDCP19113 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDCP19113 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDCP19113 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDCP19113 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDCP19113 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDCP19113 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDCP19113 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HDCP19113 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDCP19113 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDCP19113 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDCP19113 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDCP19113 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDCP19113 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDCP19113 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDCP19113 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDCP19113 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDCP19113 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDCP19113 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDCP19113 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDCP19113 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDCP19113 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDCP19113 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDCP19113 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDCP19113 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDCP19113 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDCP19113 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDCP19113 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms