Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT4P19013 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT4P19013 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT4P19013 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT4P19013 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT4P19013 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT4P19013 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT4P19013 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT4P19013 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT4P19013 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT4P19013 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT4P19013 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT4P19013 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT4P19013 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT4P19013 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT4P19013 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT4P19013 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT4P19013 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT4P19013 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT4P19013 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT4P19013 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT4P19013 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT4P19013 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT4P19013 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT4P19013 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT4P19013 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT4P19013 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT4P19013 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT4P19013 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT4P19013 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT4P19013 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT4P19013 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT4P19013 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT4P19013 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT4P19013 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT4P19013 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT4P19013 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT4P19013 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT4P19013 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT4P19013 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT4P19013 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT4P19013 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT4P19013 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT4P19013 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT4P19013 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT4P19013 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT4P19013 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT4P19013 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT4P19013 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT4P19013 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT4P19013 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT4P19013 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT4P19013 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT4P19013 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT4P19013 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT4P19013 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT4P19013 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT4P19013 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT4P19013 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT4P19013 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT4P19013 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT4P19013 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT4P19013 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT4P19013 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT4P19013 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT4P19013 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT4P19013 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT4P19013 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT4P19013 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT4P19013 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT4P19013 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT4P19013 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT4P19013 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT4P19013 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT4P19013 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT4P19013 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT4P19013 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT4P19013 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT4P19013 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT4P19013 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT4P19013 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT4P19013 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT4P19013 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT4P19013 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT4P19013 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT4P19013 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT4P19013 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT4P19013 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT4P19013 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT4P19013 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT4P19013 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT4P19013 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT4P19013 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT4P19013 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT4P19013 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT4P19013 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT4P19013 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT4P19013 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT4P19013 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT4P19013 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms