Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYN1P17600 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYN1P17600 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYN1P17600 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYN1P17600 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYN1P17600 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYN1P17600 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYN1P17600 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYN1P17600 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYN1P17600 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYN1P17600 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYN1P17600 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYN1P17600 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYN1P17600 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYN1P17600 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYN1P17600 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYN1P17600 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYN1P17600 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYN1P17600 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYN1P17600 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYN1P17600 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYN1P17600 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYN1P17600 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYN1P17600 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYN1P17600 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYN1P17600 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYN1P17600 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYN1P17600 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYN1P17600 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYN1P17600 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYN1P17600 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYN1P17600 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYN1P17600 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYN1P17600 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYN1P17600 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYN1P17600 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYN1P17600 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYN1P17600 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYN1P17600 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYN1P17600 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYN1P17600 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYN1P17600 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYN1P17600 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYN1P17600 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYN1P17600 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYN1P17600 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYN1P17600 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYN1P17600 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYN1P17600 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYN1P17600 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYN1P17600 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYN1P17600 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYN1P17600 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYN1P17600 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYN1P17600 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYN1P17600 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYN1P17600 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYN1P17600 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYN1P17600 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYN1P17600 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYN1P17600 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYN1P17600 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYN1P17600 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYN1P17600 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYN1P17600 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYN1P17600 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYN1P17600 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYN1P17600 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYN1P17600 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYN1P17600 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYN1P17600 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYN1P17600 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYN1P17600 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYN1P17600 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYN1P17600 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYN1P17600 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYN1P17600 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYN1P17600 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYN1P17600 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYN1P17600 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYN1P17600 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYN1P17600 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYN1P17600 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYN1P17600 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms