Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMPD1P17405 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms