Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCP1P13796 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LCP1P13796 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCP1P13796 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCP1P13796 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCP1P13796 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCP1P13796 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCP1P13796 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCP1P13796 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCP1P13796 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCP1P13796 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCP1P13796 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCP1P13796 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCP1P13796 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCP1P13796 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCP1P13796 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCP1P13796 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCP1P13796 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCP1P13796 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCP1P13796 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCP1P13796 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCP1P13796 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCP1P13796 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCP1P13796 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCP1P13796 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LCP1P13796 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCP1P13796 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCP1P13796 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCP1P13796 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCP1P13796 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCP1P13796 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCP1P13796 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCP1P13796 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCP1P13796 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCP1P13796 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCP1P13796 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCP1P13796 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCP1P13796 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCP1P13796 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LCP1P13796 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCP1P13796 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCP1P13796 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCP1P13796 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCP1P13796 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCP1P13796 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCP1P13796 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCP1P13796 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCP1P13796 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCP1P13796 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LCP1P13796 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LCP1P13796 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LCP1P13796 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LCP1P13796 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCP1P13796 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCP1P13796 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LCP1P13796 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCP1P13796 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCP1P13796 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCP1P13796 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCP1P13796 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LCP1P13796 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCP1P13796 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCP1P13796 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCP1P13796 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCP1P13796 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCP1P13796 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCP1P13796 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCP1P13796 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCP1P13796 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCP1P13796 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCP1P13796 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCP1P13796 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCP1P13796 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCP1P13796 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCP1P13796 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCP1P13796 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCP1P13796 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCP1P13796 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCP1P13796 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCP1P13796 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LCP1P13796 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCP1P13796 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCP1P13796 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCP1P13796 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCP1P13796 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCP1P13796 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCP1P13796 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCP1P13796 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCP1P13796 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCP1P13796 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCP1P13796 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCP1P13796 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCP1P13796 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCP1P13796 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCP1P13796 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCP1P13796 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCP1P13796 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCP1P13796 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCP1P13796 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCP1P13796 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms