Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HLA-DOBP13765 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms