Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIP12755 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIP12755 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIP12755 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIP12755 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIP12755 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIP12755 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIP12755 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIP12755 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKIP12755 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIP12755 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIP12755 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIP12755 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIP12755 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIP12755 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIP12755 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIP12755 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKIP12755 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIP12755 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIP12755 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIP12755 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIP12755 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIP12755 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKIP12755 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKIP12755 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKIP12755 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKIP12755 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKIP12755 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKIP12755 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKIP12755 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKIP12755 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKIP12755 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKIP12755 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKIP12755 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKIP12755 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKIP12755 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKIP12755 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKIP12755 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIP12755 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIP12755 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIP12755 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIP12755 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIP12755 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKIP12755 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIP12755 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIP12755 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIP12755 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIP12755 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIP12755 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIP12755 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIP12755 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIP12755 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIP12755 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIP12755 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIP12755 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIP12755 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIP12755 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIP12755 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIP12755 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIP12755 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIP12755 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIP12755 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIP12755 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIP12755 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIP12755 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIP12755 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIP12755 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIP12755 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIP12755 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIP12755 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIP12755 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIP12755 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIP12755 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIP12755 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIP12755 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIP12755 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIP12755 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIP12755 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIP12755 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIP12755 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIP12755 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIP12755 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIP12755 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIP12755 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIP12755 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIP12755 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIP12755 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIP12755 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIP12755 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIP12755 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIP12755 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIP12755 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIP12755 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIP12755 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIP12755 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIP12755 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIP12755 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIP12755 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIP12755 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIP12755 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms