Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HARSP12081 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HARSP12081 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HARSP12081 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HARSP12081 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HARSP12081 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HARSP12081 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARSP12081 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARSP12081 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARSP12081 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARSP12081 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARSP12081 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARSP12081 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARSP12081 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARSP12081 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HARSP12081 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARSP12081 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARSP12081 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HARSP12081 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HARSP12081 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HARSP12081 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HARSP12081 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HARSP12081 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HARSP12081 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HARSP12081 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HARSP12081 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HARSP12081 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HARSP12081 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HARSP12081 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HARSP12081 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HARSP12081 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HARSP12081 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HARSP12081 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HARSP12081 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HARSP12081 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HARSP12081 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HARSP12081 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HARSP12081 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HARSP12081 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HARSP12081 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HARSP12081 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HARSP12081 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HARSP12081 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HARSP12081 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HARSP12081 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HARSP12081 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HARSP12081 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HARSP12081 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HARSP12081 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HARSP12081 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARSP12081 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARSP12081 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARSP12081 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARSP12081 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARSP12081 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARSP12081 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARSP12081 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARSP12081 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARSP12081 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARSP12081 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARSP12081 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARSP12081 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HARSP12081 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HARSP12081 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HARSP12081 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HARSP12081 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HARSP12081 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HARSP12081 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HARSP12081 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HARSP12081 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HARSP12081 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HARSP12081 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HARSP12081 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HARSP12081 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HARSP12081 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HARSP12081 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HARSP12081 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HARSP12081 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HARSP12081 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HARSP12081 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HARSP12081 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HARSP12081 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HARSP12081 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARSP12081 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARSP12081 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARSP12081 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HARSP12081 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARSP12081 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARSP12081 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARSP12081 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARSP12081 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARSP12081 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARSP12081 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARSP12081 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARSP12081 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARSP12081 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARSP12081 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HARSP12081 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HARSP12081 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HARSP12081 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms