Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRFP10586 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRFP10586 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRFP10586 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms