Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARAP10276 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARAP10276 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARAP10276 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARAP10276 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARAP10276 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARAP10276 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARAP10276 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARAP10276 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARAP10276 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARAP10276 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARAP10276 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARAP10276 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARAP10276 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARAP10276 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARAP10276 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARAP10276 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARAP10276 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARAP10276 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RARAP10276 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARAP10276 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARAP10276 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARAP10276 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARAP10276 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARAP10276 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RARAP10276 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARAP10276 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARAP10276 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARAP10276 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RARAP10276 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RARAP10276 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARAP10276 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RARAP10276 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RARAP10276 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARAP10276 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARAP10276 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RARAP10276 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARAP10276 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARAP10276 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARAP10276 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARAP10276 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARAP10276 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARAP10276 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARAP10276 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARAP10276 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARAP10276 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARAP10276 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARAP10276 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARAP10276 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARAP10276 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARAP10276 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARAP10276 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARAP10276 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARAP10276 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARAP10276 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARAP10276 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARAP10276 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARAP10276 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARAP10276 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARAP10276 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RARAP10276 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARAP10276 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARAP10276 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARAP10276 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARAP10276 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARAP10276 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARAP10276 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARAP10276 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARAP10276 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARAP10276 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARAP10276 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARAP10276 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARAP10276 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARAP10276 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARAP10276 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARAP10276 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RARAP10276 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RARAP10276 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RARAP10276 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARAP10276 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARAP10276 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARAP10276 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARAP10276 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARAP10276 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARAP10276 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARAP10276 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARAP10276 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARAP10276 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARAP10276 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARAP10276 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARAP10276 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RARAP10276 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARAP10276 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARAP10276 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARAP10276 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARAP10276 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARAP10276 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARAP10276 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARAP10276 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARAP10276 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms