Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM225BP0DP42 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms