Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF888P0CJ79 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF888P0CJ79 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF888P0CJ79 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF888P0CJ79 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF888P0CJ79 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF888P0CJ79 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF888P0CJ79 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms