Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M6

IQCF3, IQ domain-containing protein F3, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCF3P0C7M6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IQCF3P0C7M6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IQCF3P0C7M6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms