Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN1P07384 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN1P07384 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 307.5 ms