Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CSF1RP07333 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSF1RP07333 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSF1RP07333 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms