Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALB1P05937 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALB1P05937 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALB1P05937 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB1P05937 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB1P05937 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB1P05937 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB1P05937 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB1P05937 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB1P05937 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB1P05937 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB1P05937 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB1P05937 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALB1P05937 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALB1P05937 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CALB1P05937 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALB1P05937 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB1P05937 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB1P05937 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB1P05937 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB1P05937 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB1P05937 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB1P05937 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB1P05937 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB1P05937 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB1P05937 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB1P05937 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALB1P05937 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB1P05937 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB1P05937 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB1P05937 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB1P05937 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB1P05937 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB1P05937 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB1P05937 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB1P05937 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB1P05937 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALB1P05937 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALB1P05937 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALB1P05937 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CALB1P05937 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALB1P05937 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALB1P05937 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALB1P05937 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALB1P05937 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB1P05937 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB1P05937 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB1P05937 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB1P05937 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB1P05937 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB1P05937 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB1P05937 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB1P05937 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB1P05937 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB1P05937 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB1P05937 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB1P05937 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB1P05937 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALB1P05937 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALB1P05937 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALB1P05937 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALB1P05937 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALB1P05937 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALB1P05937 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALB1P05937 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALB1P05937 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALB1P05937 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALB1P05937 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALB1P05937 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALB1P05937 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALB1P05937 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALB1P05937 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALB1P05937 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALB1P05937 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALB1P05937 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALB1P05937 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALB1P05937 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALB1P05937 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALB1P05937 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALB1P05937 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALB1P05937 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALB1P05937 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALB1P05937 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALB1P05937 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALB1P05937 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALB1P05937 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALB1P05937 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALB1P05937 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALB1P05937 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALB1P05937 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALB1P05937 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALB1P05937 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALB1P05937 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALB1P05937 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALB1P05937 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALB1P05937 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALB1P05937 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALB1P05937 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALB1P05937 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALB1P05937 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms