Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPIND1P05546 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms