Protein–RNA interactions for Protein: P04040

CAT, Catalase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATP04040 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CATP04040 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CATP04040 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CATP04040 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CATP04040 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CATP04040 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CATP04040 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CATP04040 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CATP04040 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATP04040 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATP04040 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATP04040 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATP04040 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATP04040 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CATP04040 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATP04040 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATP04040 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATP04040 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATP04040 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATP04040 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATP04040 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATP04040 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATP04040 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATP04040 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATP04040 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATP04040 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATP04040 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATP04040 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATP04040 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATP04040 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATP04040 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATP04040 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATP04040 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATP04040 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATP04040 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CATP04040 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CATP04040 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATP04040 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATP04040 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATP04040 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATP04040 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATP04040 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATP04040 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATP04040 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATP04040 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATP04040 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATP04040 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATP04040 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATP04040 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATP04040 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATP04040 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATP04040 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATP04040 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATP04040 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATP04040 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATP04040 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATP04040 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATP04040 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATP04040 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATP04040 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATP04040 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATP04040 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATP04040 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATP04040 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATP04040 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATP04040 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATP04040 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATP04040 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATP04040 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATP04040 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATP04040 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATP04040 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATP04040 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATP04040 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATP04040 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATP04040 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATP04040 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATP04040 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATP04040 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATP04040 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATP04040 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATP04040 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATP04040 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms