Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBE1P02100 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBE1P02100 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBE1P02100 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBE1P02100 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBE1P02100 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBE1P02100 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBE1P02100 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBE1P02100 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBE1P02100 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBE1P02100 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HBE1P02100 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBE1P02100 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBE1P02100 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBE1P02100 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBE1P02100 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBE1P02100 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBE1P02100 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBE1P02100 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBE1P02100 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HBE1P02100 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBE1P02100 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBE1P02100 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBE1P02100 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBE1P02100 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBE1P02100 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBE1P02100 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBE1P02100 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBE1P02100 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBE1P02100 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBE1P02100 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBE1P02100 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HBE1P02100 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBE1P02100 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBE1P02100 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBE1P02100 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBE1P02100 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBE1P02100 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBE1P02100 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBE1P02100 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBE1P02100 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBE1P02100 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HBE1P02100 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HBE1P02100 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HBE1P02100 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HBE1P02100 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HBE1P02100 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HBE1P02100 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HBE1P02100 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HBE1P02100 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HBE1P02100 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HBE1P02100 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBE1P02100 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBE1P02100 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBE1P02100 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBE1P02100 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBE1P02100 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBE1P02100 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBE1P02100 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBE1P02100 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBE1P02100 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBE1P02100 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HBE1P02100 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HBE1P02100 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HBE1P02100 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBE1P02100 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBE1P02100 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBE1P02100 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBE1P02100 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBE1P02100 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HBE1P02100 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBE1P02100 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBE1P02100 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBE1P02100 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBE1P02100 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBE1P02100 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBE1P02100 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBE1P02100 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBE1P02100 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HBE1P02100 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBE1P02100 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBE1P02100 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBE1P02100 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBE1P02100 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBE1P02100 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBE1P02100 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBE1P02100 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBE1P02100 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBE1P02100 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBE1P02100 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBE1P02100 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBE1P02100 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBE1P02100 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBE1P02100 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBE1P02100 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HBE1P02100 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBE1P02100 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBE1P02100 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBE1P02100 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBE1P02100 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms