Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EGFRP00533 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EGFRP00533 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EGFRP00533 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
EGFRP00533 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EGFRP00533 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EGFRP00533 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EGFRP00533 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EGFRP00533 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EGFRP00533 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EGFRP00533 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EGFRP00533 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EGFRP00533 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EGFRP00533 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
EGFRP00533 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EGFRP00533 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EGFRP00533 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
EGFRP00533 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EGFRP00533 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EGFRP00533 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EGFRP00533 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EGFRP00533 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EGFRP00533 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EGFRP00533 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EGFRP00533 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EGFRP00533 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EGFRP00533 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EGFRP00533 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EGFRP00533 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
EGFRP00533 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EGFRP00533 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EGFRP00533 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EGFRP00533 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EGFRP00533 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EGFRP00533 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EGFRP00533 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EGFRP00533 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EGFRP00533 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EGFRP00533 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EGFRP00533 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EGFRP00533 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EGFRP00533 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EGFRP00533 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EGFRP00533 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EGFRP00533 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EGFRP00533 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EGFRP00533 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EGFRP00533 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EGFRP00533 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EGFRP00533 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EGFRP00533 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EGFRP00533 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EGFRP00533 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EGFRP00533 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
EGFRP00533 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EGFRP00533 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EGFRP00533 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EGFRP00533 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EGFRP00533 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EGFRP00533 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EGFRP00533 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EGFRP00533 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EGFRP00533 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EGFRP00533 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EGFRP00533 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EGFRP00533 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EGFRP00533 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EGFRP00533 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EGFRP00533 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EGFRP00533 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EGFRP00533 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EGFRP00533 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EGFRP00533 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EGFRP00533 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EGFRP00533 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EGFRP00533 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EGFRP00533 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EGFRP00533 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EGFRP00533 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EGFRP00533 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EGFRP00533 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EGFRP00533 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EGFRP00533 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EGFRP00533 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EGFRP00533 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EGFRP00533 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EGFRP00533 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EGFRP00533 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EGFRP00533 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EGFRP00533 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EGFRP00533 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EGFRP00533 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EGFRP00533 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EGFRP00533 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EGFRP00533 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EGFRP00533 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EGFRP00533 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EGFRP00533 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
EGFRP00533 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EGFRP00533 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms