Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4FO95754 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms