Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAMEF1O95521 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms