Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNDBP1O95273 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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