Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP12O75317 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP12O75317 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP12O75317 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP12O75317 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP12O75317 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP12O75317 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP12O75317 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP12O75317 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP12O75317 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP12O75317 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP12O75317 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP12O75317 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP12O75317 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP12O75317 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP12O75317 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP12O75317 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP12O75317 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP12O75317 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP12O75317 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP12O75317 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP12O75317 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP12O75317 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP12O75317 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP12O75317 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP12O75317 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP12O75317 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP12O75317 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP12O75317 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP12O75317 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP12O75317 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP12O75317 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP12O75317 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP12O75317 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP12O75317 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP12O75317 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP12O75317 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP12O75317 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP12O75317 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP12O75317 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP12O75317 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP12O75317 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP12O75317 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP12O75317 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP12O75317 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP12O75317 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP12O75317 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP12O75317 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP12O75317 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP12O75317 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP12O75317 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP12O75317 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP12O75317 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP12O75317 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP12O75317 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP12O75317 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP12O75317 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP12O75317 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP12O75317 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP12O75317 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP12O75317 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP12O75317 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP12O75317 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP12O75317 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP12O75317 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP12O75317 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP12O75317 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP12O75317 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP12O75317 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP12O75317 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP12O75317 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP12O75317 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP12O75317 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP12O75317 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP12O75317 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP12O75317 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP12O75317 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP12O75317 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP12O75317 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP12O75317 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP12O75317 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP12O75317 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP12O75317 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP12O75317 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP12O75317 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP12O75317 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP12O75317 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP12O75317 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP12O75317 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP12O75317 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP12O75317 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP12O75317 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP12O75317 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP12O75317 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP12O75317 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP12O75317 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP12O75317 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP12O75317 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP12O75317 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP12O75317 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms