Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RAB11FIP3O75154 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAB11FIP3O75154 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms