Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBNO60934 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBNO60934 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBNO60934 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBNO60934 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBNO60934 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBNO60934 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBNO60934 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NBNO60934 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBNO60934 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBNO60934 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBNO60934 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBNO60934 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBNO60934 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBNO60934 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBNO60934 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBNO60934 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBNO60934 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBNO60934 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBNO60934 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NBNO60934 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBNO60934 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBNO60934 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBNO60934 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NBNO60934 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBNO60934 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBNO60934 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBNO60934 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBNO60934 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBNO60934 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBNO60934 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBNO60934 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBNO60934 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBNO60934 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBNO60934 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBNO60934 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBNO60934 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBNO60934 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBNO60934 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NBNO60934 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBNO60934 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBNO60934 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NBNO60934 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NBNO60934 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NBNO60934 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBNO60934 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBNO60934 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBNO60934 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBNO60934 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBNO60934 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBNO60934 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBNO60934 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBNO60934 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBNO60934 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBNO60934 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBNO60934 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBNO60934 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBNO60934 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBNO60934 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBNO60934 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NBNO60934 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NBNO60934 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NBNO60934 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBNO60934 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBNO60934 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBNO60934 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBNO60934 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBNO60934 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBNO60934 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBNO60934 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBNO60934 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBNO60934 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBNO60934 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBNO60934 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBNO60934 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBNO60934 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBNO60934 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBNO60934 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBNO60934 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBNO60934 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NBNO60934 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBNO60934 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBNO60934 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBNO60934 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBNO60934 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBNO60934 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBNO60934 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NBNO60934 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBNO60934 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBNO60934 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBNO60934 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NBNO60934 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBNO60934 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBNO60934 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBNO60934 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBNO60934 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBNO60934 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBNO60934 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBNO60934 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBNO60934 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms