Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms