Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN3BO60391 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms