Protein–RNA interactions for Protein: O43809

NUDT21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT21O43809 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NUDT21O43809 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDT21O43809 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDT21O43809 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms