Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT86O43790 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT86O43790 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT86O43790 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT86O43790 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT86O43790 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT86O43790 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT86O43790 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT86O43790 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT86O43790 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT86O43790 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT86O43790 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT86O43790 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT86O43790 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT86O43790 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT86O43790 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT86O43790 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT86O43790 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT86O43790 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT86O43790 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT86O43790 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT86O43790 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT86O43790 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT86O43790 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT86O43790 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT86O43790 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT86O43790 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT86O43790 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT86O43790 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT86O43790 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT86O43790 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT86O43790 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT86O43790 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT86O43790 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT86O43790 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT86O43790 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT86O43790 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT86O43790 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT86O43790 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT86O43790 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT86O43790 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT86O43790 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT86O43790 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT86O43790 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT86O43790 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT86O43790 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT86O43790 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT86O43790 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT86O43790 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT86O43790 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT86O43790 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT86O43790 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT86O43790 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT86O43790 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT86O43790 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT86O43790 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT86O43790 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT86O43790 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT86O43790 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT86O43790 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT86O43790 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT86O43790 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT86O43790 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT86O43790 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT86O43790 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT86O43790 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT86O43790 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT86O43790 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT86O43790 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT86O43790 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT86O43790 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT86O43790 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT86O43790 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT86O43790 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT86O43790 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT86O43790 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT86O43790 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT86O43790 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT86O43790 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT86O43790 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT86O43790 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT86O43790 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT86O43790 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT86O43790 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT86O43790 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT86O43790 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT86O43790 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT86O43790 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT86O43790 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT86O43790 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT86O43790 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT86O43790 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT86O43790 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT86O43790 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT86O43790 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT86O43790 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT86O43790 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT86O43790 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT86O43790 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT86O43790 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms