Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms