Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRC1O43663 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRC1O43663 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRC1O43663 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRC1O43663 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRC1O43663 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRC1O43663 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRC1O43663 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRC1O43663 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRC1O43663 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRC1O43663 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRC1O43663 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRC1O43663 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRC1O43663 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRC1O43663 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRC1O43663 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRC1O43663 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRC1O43663 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRC1O43663 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRC1O43663 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRC1O43663 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRC1O43663 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRC1O43663 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRC1O43663 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRC1O43663 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRC1O43663 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRC1O43663 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRC1O43663 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRC1O43663 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRC1O43663 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRC1O43663 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRC1O43663 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRC1O43663 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRC1O43663 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRC1O43663 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRC1O43663 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRC1O43663 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PRC1O43663 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRC1O43663 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRC1O43663 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRC1O43663 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRC1O43663 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRC1O43663 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRC1O43663 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRC1O43663 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRC1O43663 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRC1O43663 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRC1O43663 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRC1O43663 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRC1O43663 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRC1O43663 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRC1O43663 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRC1O43663 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRC1O43663 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRC1O43663 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRC1O43663 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRC1O43663 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRC1O43663 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRC1O43663 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRC1O43663 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRC1O43663 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRC1O43663 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRC1O43663 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRC1O43663 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRC1O43663 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRC1O43663 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRC1O43663 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRC1O43663 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRC1O43663 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRC1O43663 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRC1O43663 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRC1O43663 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRC1O43663 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRC1O43663 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRC1O43663 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRC1O43663 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRC1O43663 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRC1O43663 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRC1O43663 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRC1O43663 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRC1O43663 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRC1O43663 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRC1O43663 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRC1O43663 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRC1O43663 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRC1O43663 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRC1O43663 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRC1O43663 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRC1O43663 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRC1O43663 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRC1O43663 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRC1O43663 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRC1O43663 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRC1O43663 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRC1O43663 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRC1O43663 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRC1O43663 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRC1O43663 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRC1O43663 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRC1O43663 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms