Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCNQ3O43525 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNQ3O43525 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNQ3O43525 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms