Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA5O15230 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA5O15230 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms