Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARPC1BO15143 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARPC1BO15143 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms