Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
KIF3BO15066 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
KIF3BO15066 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
KIF3BO15066 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
KIF3BO15066 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KIF3BO15066 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KIF3BO15066 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KIF3BO15066 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KIF3BO15066 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KIF3BO15066 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KIF3BO15066 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KIF3BO15066 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KIF3BO15066 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KIF3BO15066 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KIF3BO15066 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
KIF3BO15066 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KIF3BO15066 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms