Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEMA3EO15041 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms