Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
APAF1O14727 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
APAF1O14727 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
APAF1O14727 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
APAF1O14727 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
APAF1O14727 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
APAF1O14727 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
APAF1O14727 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
APAF1O14727 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
APAF1O14727 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
APAF1O14727 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
APAF1O14727 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
APAF1O14727 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
APAF1O14727 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
APAF1O14727 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
APAF1O14727 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
APAF1O14727 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
APAF1O14727 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
APAF1O14727 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
APAF1O14727 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
APAF1O14727 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
APAF1O14727 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
APAF1O14727 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
APAF1O14727 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
APAF1O14727 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
APAF1O14727 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
APAF1O14727 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
APAF1O14727 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
APAF1O14727 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
APAF1O14727 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
APAF1O14727 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
APAF1O14727 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
APAF1O14727 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
APAF1O14727 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
APAF1O14727 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
APAF1O14727 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
APAF1O14727 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
APAF1O14727 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
APAF1O14727 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
APAF1O14727 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
APAF1O14727 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
APAF1O14727 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
APAF1O14727 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
APAF1O14727 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
APAF1O14727 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
APAF1O14727 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
APAF1O14727 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
APAF1O14727 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
APAF1O14727 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
APAF1O14727 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
APAF1O14727 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
APAF1O14727 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
APAF1O14727 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
APAF1O14727 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
APAF1O14727 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
APAF1O14727 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
APAF1O14727 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
APAF1O14727 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
APAF1O14727 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
APAF1O14727 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
APAF1O14727 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
APAF1O14727 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APAF1O14727 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APAF1O14727 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APAF1O14727 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APAF1O14727 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
APAF1O14727 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APAF1O14727 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
APAF1O14727 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APAF1O14727 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APAF1O14727 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
APAF1O14727 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
APAF1O14727 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APAF1O14727 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APAF1O14727 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
APAF1O14727 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
APAF1O14727 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APAF1O14727 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APAF1O14727 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
APAF1O14727 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APAF1O14727 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APAF1O14727 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APAF1O14727 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APAF1O14727 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APAF1O14727 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APAF1O14727 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
APAF1O14727 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APAF1O14727 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
APAF1O14727 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
APAF1O14727 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
APAF1O14727 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
APAF1O14727 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
APAF1O14727 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
APAF1O14727 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
APAF1O14727 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
APAF1O14727 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
APAF1O14727 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
APAF1O14727 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
APAF1O14727 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
APAF1O14727 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms