Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
PTPRTO14522 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRTO14522 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRTO14522 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRTO14522 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRTO14522 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRTO14522 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRTO14522 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRTO14522 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRTO14522 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRTO14522 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRTO14522 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRTO14522 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRTO14522 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRTO14522 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRTO14522 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRTO14522 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRTO14522 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRTO14522 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRTO14522 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PTPRTO14522 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRTO14522 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRTO14522 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRTO14522 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PTPRTO14522 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRTO14522 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRTO14522 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRTO14522 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRTO14522 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRTO14522 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRTO14522 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRTO14522 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRTO14522 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRTO14522 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRTO14522 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRTO14522 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRTO14522 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
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