Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PODXLO00592 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PODXLO00592 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PODXLO00592 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PODXLO00592 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PODXLO00592 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PODXLO00592 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PODXLO00592 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PODXLO00592 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PODXLO00592 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PODXLO00592 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PODXLO00592 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PODXLO00592 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PODXLO00592 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PODXLO00592 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PODXLO00592 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PODXLO00592 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PODXLO00592 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PODXLO00592 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PODXLO00592 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PODXLO00592 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PODXLO00592 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PODXLO00592 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PODXLO00592 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PODXLO00592 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PODXLO00592 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PODXLO00592 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PODXLO00592 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PODXLO00592 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PODXLO00592 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PODXLO00592 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PODXLO00592 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PODXLO00592 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PODXLO00592 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PODXLO00592 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PODXLO00592 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PODXLO00592 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PODXLO00592 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PODXLO00592 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXLO00592 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXLO00592 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXLO00592 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXLO00592 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXLO00592 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXLO00592 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PODXLO00592 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXLO00592 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXLO00592 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXLO00592 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXLO00592 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXLO00592 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXLO00592 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXLO00592 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PODXLO00592 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXLO00592 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXLO00592 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXLO00592 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXLO00592 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXLO00592 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXLO00592 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXLO00592 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PODXLO00592 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXLO00592 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXLO00592 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXLO00592 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXLO00592 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXLO00592 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXLO00592 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXLO00592 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXLO00592 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXLO00592 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXLO00592 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXLO00592 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXLO00592 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXLO00592 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXLO00592 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXLO00592 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PODXLO00592 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXLO00592 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXLO00592 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXLO00592 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXLO00592 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXLO00592 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXLO00592 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXLO00592 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXLO00592 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXLO00592 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXLO00592 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXLO00592 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXLO00592 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PODXLO00592 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXLO00592 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXLO00592 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXLO00592 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXLO00592 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXLO00592 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXLO00592 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXLO00592 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXLO00592 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PODXLO00592 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms