Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MEIS1O00470 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS1O00470 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS1O00470 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms