Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF5O00463 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF5O00463 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF5O00463 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF5O00463 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF5O00463 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF5O00463 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF5O00463 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF5O00463 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF5O00463 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF5O00463 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRAF5O00463 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF5O00463 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF5O00463 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF5O00463 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRAF5O00463 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF5O00463 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRAF5O00463 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF5O00463 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF5O00463 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF5O00463 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF5O00463 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAF5O00463 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF5O00463 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms