Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFKBIEO00221 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFKBIEO00221 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms