Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYO1FO00160 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1FO00160 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1FO00160 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1FO00160 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1FO00160 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1FO00160 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1FO00160 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1FO00160 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms