Protein–RNA interactions for Protein: O00159

MYO1C, Unconventional myosin-Ic, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1CO00159 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYO1CO00159 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYO1CO00159 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYO1CO00159 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYO1CO00159 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYO1CO00159 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYO1CO00159 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYO1CO00159 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms