Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H3BRM9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H3BRM9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H3BRM9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H3BRM9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H3BRM9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H3BRM9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H3BRM9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H3BRM9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H3BRM9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H3BRM9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H3BRM9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H3BRM9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H3BRM9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H3BRM9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H3BRM9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H3BRM9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H3BRM9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H3BRM9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H3BRM9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H3BRM9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H3BRM9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H3BRM9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H3BRM9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H3BRM9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H3BRM9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H3BRM9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H3BRM9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H3BRM9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H3BRM9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H3BRM9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H3BRM9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H3BRM9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H3BRM9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H3BRM9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H3BRM9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H3BRM9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H3BRM9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H3BRM9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H3BRM9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H3BRM9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H3BRM9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H3BRM9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H3BRM9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H3BRM9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BRM9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BRM9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BRM9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BRM9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BRM9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BRM9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BRM9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BRM9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BRM9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BRM9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BRM9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BRM9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BRM9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BRM9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BRM9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BRM9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BRM9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BRM9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BRM9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BRM9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BRM9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BRM9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms