Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPB9F8W1W9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NPIPB9F8W1W9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms