Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO7DNF2Z398 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 949.4 ms